Preriscaldare il forno a 400F.

Eliminare la pelle cartacea in eccesso dalle teste d'aglio, senza separare gli spicchi, e tagliare circa mezzo centimetro dalla parte superiore. Posizionare ogni testa su un quadrato di carta stagnola (con l'estremità tagliata verso l'alto). Cospargere ogni testa con 1 cucchiaio d'acqua e unire i bordi della carta stagnola per formare un pacchetto. Arrostire fino a quando i chiodi di garofano sono molto morbidi, da 40 a 50 minuti. Togliere l'involucro e lasciare raffreddare leggermente. Spremere i chiodi di garofano dalla buccia in una piccola ciotola; mettere da parte.

Scaldare l'olio in una casseruola a fuoco basso. Aggiungere lo scalogno e cuocere finché non si ammorbidisce, da 1 a 2 minuti. Aggiungere la maggiorana e il pepe rosso schiacciato; cuocere fino a quando non si sente l'aroma, circa 30 secondi. Aggiungere il vino e portare a ebollizione. Aumentare la fiamma a medio-alto e cuocere fino a quando il composto si sarà ridotto a 1/4 di tazza, da 10 a 14 minuti (il vino sarà quasi evaporato). Ridurre la fiamma a basso; aggiungere il succo di vongole e l'aglio arrostito e frullare fino a ottenere un composto omogeneo. Mescolare le vongole e 1/4 di tazza di prezzemolo; riscaldare delicatamente a fuoco basso. Tenere la salsa in caldo.

Cuocere la pasta in una grande pentola d'acqua bollente salata fino a quando è appena tenera, da 8 a 10 minuti o secondo le indicazioni della confezione.

Nel frattempo, preparare la gremolata: unire 1/4 di tazza di prezzemolo, la scorza di limone e lo spicchio d'aglio; mescolare bene.

Scolare la pasta e trasferirla in una ciotola grande e calda. Mescolare il succo di limone e il burro alla salsa di vongole e versare sulla pasta. Mescolare delicatamente, quindi cospargere la gremolata. Servire immediatamente, con spicchi di limone.